More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1602 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 641 aa  1269    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.43 
 
 		 608 aa  227  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  31.97 
 
 		 621 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.65 
 
 		 586 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  34.82 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  33.17 
 
 		 586 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  31.42 
 
 		 621 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  33.11 
 
 		 587 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  29.98 
 
 		 504 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  30.43 
 
 		 502 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.86 
 
 		 432 aa  134  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.87 
 
 		 501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  29.8 
 
 		 503 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 		 634 aa  123  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 		 502 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  34.77 
 
 		 405 aa  111  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  29.3 
 
 		 517 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  30.19 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  25.43 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.66 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  24.41 
 
 		 514 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.75 
 
 		 400 aa  97.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 		 489 aa  96.3  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.6 
 
 		 448 aa  95.1  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.31 
 
 		 509 aa  94.4  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  27.38 
 
 		 500 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.6 
 
 		 448 aa  90.5  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.08 
 
 		 500 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 377 aa  87.8  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 		 397 aa  87.8  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  27.33 
 
 		 417 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0535  hypothetical protein  43.85 
 
 		 222 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  24.87 
 
 		 533 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 622 aa  85.9  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  28.04 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  27.66 
 
 		 541 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.04 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  30.86 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  25.21 
 
 		 631 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  31.02 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  23.82 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.02 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  31.65 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  30.9 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 		 504 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  33.68 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2731  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  29.65 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 		 663 aa  78.2  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.91 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  33.98 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.74 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 609 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.31 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.97 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  28.4 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10570  hypothetical protein  31.61 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  28.97 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.2 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  28.31 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  28.49 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  28.31 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  28.31 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  28.31 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  28.26 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  28.31 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  28.31 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  29.06 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.92 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  31.58 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  28.31 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  31.02 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  29.49 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.04 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  28.15 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  28.44 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  29.49 
 
 		 372 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 		 521 aa  73.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  34.87 
 
 		 366 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  28.04 
 
 		 467 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  28.2 
 
 		 421 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  25.78 
 
 		 607 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  29 
 
 		 360 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  30.05 
 
 		 443 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  29.03 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  24.23 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>