More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1522 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
422 aa  847    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.93 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  38.85 
 
 
439 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.22 
 
 
463 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.22 
 
 
463 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  37.73 
 
 
437 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.85 
 
 
401 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.37 
 
 
467 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
496 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
496 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2368  secretion protein HlyD  33.01 
 
 
376 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108323  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  31.05 
 
 
364 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  31.36 
 
 
376 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  29.61 
 
 
375 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  36.14 
 
 
634 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01671  membrane-fusion protein  27.89 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  25.4 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2303  secretion protein HlyD  29.61 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.951849  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.49 
 
 
397 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 
384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 
351 aa  110  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  26 
 
 
351 aa  109  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 
462 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 
462 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  23.32 
 
 
360 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.35 
 
 
379 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  25.49 
 
 
374 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  25.75 
 
 
373 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  24.01 
 
 
390 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 
377 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  25.69 
 
 
379 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  25.76 
 
 
427 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 
340 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  25.95 
 
 
418 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 
401 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.46 
 
 
388 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 
392 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  22.22 
 
 
417 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  25.21 
 
 
376 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  24.33 
 
 
361 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 
378 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 
391 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  23.92 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.61 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  26.29 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  25.86 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  23.47 
 
 
368 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  25.75 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  22.57 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
416 aa  97.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  26.02 
 
 
428 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2038  RND family efflux transporter MFP subunit  25.95 
 
 
482 aa  96.3  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0373239  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  25.12 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  25.6 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 
380 aa  96.3  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.26 
 
 
399 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  24.75 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.14 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  21.65 
 
 
385 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  27.3 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  24.18 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.3 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  26.48 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  25.27 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  23.51 
 
 
368 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  23.84 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  25.27 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  25.27 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  25.27 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  25.27 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  23.73 
 
 
369 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  25.49 
 
 
374 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.67 
 
 
383 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  25.27 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 
394 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  24.62 
 
 
427 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  23.31 
 
 
360 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  23.31 
 
 
360 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  25.27 
 
 
455 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  23.06 
 
 
360 aa  94  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  24.73 
 
 
415 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 
405 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  26.11 
 
 
413 aa  94  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.65 
 
 
360 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.65 
 
 
360 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 
412 aa  93.2  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.87 
 
 
404 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 
386 aa  93.2  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  23.95 
 
 
371 aa  92.8  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.06 
 
 
378 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  24.32 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  25.06 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>