More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4993 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 401 aa  796    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  49.87 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  46.56 
 
 		 437 aa  339  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.09 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.86 
 
 		 496 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.4 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  37.19 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.76 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  36.98 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.09 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2368  secretion protein HlyD  35.2 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.43 
 
 		 463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.21 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  43.55 
 
 		 634 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  27.94 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  25.5 
 
 		 374 aa  113  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.53 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01671  membrane-fusion protein  27.59 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  28.25 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  28.24 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  24.23 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  24.82 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  27.99 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 389 aa  99.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.85 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.58 
 
 		 426 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  26.21 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  26.6 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3019  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.14 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.809394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 363 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 363 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4802  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1968  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000223491  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  25.85 
 
 		 386 aa  93.2  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  25.56 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.43 
 
 		 462 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.2 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.59 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.35 
 
 		 423 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.55 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1163  RND family efflux transporter MFP subunit  25.13 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 451 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  23.65 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  24.18 
 
 		 381 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.37 
 
 		 421 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  25.43 
 
 		 383 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 		 462 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 		 399 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  23.9 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  25.26 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.69 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  24.57 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  27.09 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  26 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  27.06 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  25.18 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  24.02 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  25.34 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0822  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.44 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  27.09 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.55 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3608  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.43 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.704164  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  31.9 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3091  RND family efflux transporter MFP subunit  23.63 
 
 		 426 aa  87  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542008  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  25.75 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 375 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  29.53 
 
 		 365 aa  86.7  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  23.95 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  25.48 
 
 		 414 aa  86.3  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 		 460 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.4 
 
 		 396 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 		 365 aa  86.3  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  27.47 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  25.44 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2303  secretion protein HlyD  23.37 
 
 		 357 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.951849  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  27.79 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.67 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  25 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  24.35 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  26.76 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  24.35 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2038  RND family efflux transporter MFP subunit  26.48 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0373239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.35 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  24.35 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>