More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01671 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_01671  membrane-fusion protein  100 
 
 		 366 aa  742    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  35.85 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  32.46 
 
 		 380 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2303  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.951849  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2368  secretion protein HlyD  30.11 
 
 		 376 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.89 
 
 		 422 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  28.65 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  26.1 
 
 		 439 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  23.34 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  23.5 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.88 
 
 		 426 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  23.81 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  27.03 
 
 		 426 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 		 372 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  22.58 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 381 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.93 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  23.08 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  28.62 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  25.66 
 
 		 376 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.67 
 
 		 374 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.93 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 		 388 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  24.78 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  25.86 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 390 aa  93.2  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  23.91 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  26.97 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  26.32 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.55 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  27.42 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  24.28 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  24.59 
 
 		 372 aa  90.5  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  24.4 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  22.13 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 		 382 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  24.43 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  24.48 
 
 		 417 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  24.29 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2619  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  27.58 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 		 496 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  24.54 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  25.62 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  28.11 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  26.35 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  25.48 
 
 		 381 aa  86.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.77 
 
 		 496 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  24.07 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  26.3 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  23.88 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.35 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  28.15 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  26.52 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1637  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.35 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  23.46 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  24.33 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  28.2 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  25.42 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1969  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.728278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  26.87 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  25.87 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.98 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  21.16 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  24.08 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.66 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.01 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  28.25 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  26.06 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 		 634 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>