More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1839 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1839  membrane-fusion protein  100 
 
 		 388 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00691456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1901  secretion protein HlyD family protein  69.62 
 
 		 403 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2738  membrane-fusion protein  70.93 
 
 		 399 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1470  membrane-fusion protein  59.74 
 
 		 394 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1902  membrane-fusion protein  27.06 
 
 		 419 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0558652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7080  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2737  membrane-fusion protein  23.97 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1840  membrane-fusion protein  24.08 
 
 		 429 aa  93.6  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1471  membrane-fusion protein  23.06 
 
 		 400 aa  93.2  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2739  multidrug resistance efflux pump-like protein  23 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1838  multidrug resistance efflux pump-like protein  25 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000704068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  26.96 
 
 		 607 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1469  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.76 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  22.67 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1900  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.1 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.84 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  28.43 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.6 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  27.08 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  24.32 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  28.95 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.87 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.96 
 
 		 598 aa  69.7  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.807091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  24.94 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  23.56 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  27.23 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  23.78 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  26.15 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.77 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  25.07 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  23.44 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27.96 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  21.34 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  22.02 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.74 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  25.86 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  26.79 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.73 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  26.32 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  20.63 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  24.83 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  32.41 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4837  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.55 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.78 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.39 
 
 		 580 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  28.94 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  28.1 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  20.37 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  25.46 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4074  RND family efflux transporter MFP subunit  26.62 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  24.46 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  25.83 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  20.37 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  27.66 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  26.61 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  24.63 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  27.54 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  33.33 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.11 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  24.92 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  23.99 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  24.87 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  23.08 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  24.03 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  26.71 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  25.33 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  24.03 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.31 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  23.08 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.53 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  24.87 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  28.42 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.53 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.6 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  26.8 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>