More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0495 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  100 
 
 		 323 aa  646    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  64.24 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.75 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  61.54 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  60.06 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.71 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  47.24 
 
 		 326 aa  278  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  26.78 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.39 
 
 		 428 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  23.82 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.24 
 
 		 416 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  24.93 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 		 430 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.4 
 
 		 504 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  24.78 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  26.2 
 
 		 388 aa  92.8  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  25 
 
 		 357 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  29.01 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  29.46 
 
 		 517 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  26.19 
 
 		 521 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  24.34 
 
 		 353 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 432 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  26.43 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.52 
 
 		 409 aa  90.1  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29 
 
 		 549 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  30.84 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  24.77 
 
 		 356 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 517 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.7 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  25.86 
 
 		 402 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  32.5 
 
 		 449 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 489 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.21 
 
 		 419 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.19 
 
 		 663 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  32.01 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.98 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  32.24 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.15 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  34.74 
 
 		 421 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.45 
 
 		 608 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  32.78 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  28.3 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  34.81 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.8 
 
 		 487 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.8 
 
 		 487 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  36.87 
 
 		 621 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  32.26 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.07 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.31 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  37.21 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.84 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  34.85 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  32.23 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  23.85 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  30.08 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  29.21 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  29.21 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  29.21 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  29.21 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  29.21 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  34.16 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  23.34 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  33.15 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  34.78 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  31.55 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  26.52 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.85 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  37.57 
 
 		 621 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  34.59 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  27.34 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  37.04 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.27 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  27.97 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  28.72 
 
 		 433 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 		 429 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.08 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.37 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  27.14 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  31.91 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>