More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3483 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 598 aa  1197    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.807091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.2 
 
 		 432 aa  124  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7080  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.75 
 
 		 416 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.51 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.6 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.13 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1901  secretion protein HlyD family protein  25.49 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  25.77 
 
 		 521 aa  77.8  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1470  membrane-fusion protein  29.65 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  22.79 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.79 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  30.49 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.76 
 
 		 406 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.18 
 
 		 517 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  32.68 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.73 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.92 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1868  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.73 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.03 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  23.98 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.15 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2738  membrane-fusion protein  21.41 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  26.52 
 
 		 338 aa  67  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  26.09 
 
 		 410 aa  67  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.15 
 
 		 487 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8343  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.96 
 
 		 462 aa  67  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  28.82 
 
 		 546 aa  66.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.98 
 
 		 481 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  26.52 
 
 		 338 aa  66.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  22.55 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  26.5 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1839  membrane-fusion protein  22.96 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00691456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.15 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  21.37 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1902  membrane-fusion protein  20.79 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0558652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  28.24 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  29.22 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0740  hypothetical protein  27.81 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000338455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2737  membrane-fusion protein  20.74 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.21 
 
 		 663 aa  63.9  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 503 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 504 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.15 
 
 		 322 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  24.23 
 
 		 465 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  24.83 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  24.66 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  25.2 
 
 		 396 aa  63.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  25.5 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  25.99 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1840  membrane-fusion protein  24.23 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.29 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.12 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  29.59 
 
 		 318 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  26.83 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.66 
 
 		 400 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21240  multidrug resistance efflux pump  21.44 
 
 		 536 aa  61.6  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.09 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  27.09 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.43 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  27.39 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  23.27 
 
 		 536 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  26.34 
 
 		 672 aa  61.6  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 580 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  24 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  26.79 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  28.14 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 538 aa  61.2  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0460  hypothetical protein  24.03 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  24.75 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2740  secretion protein HlyD  29.25 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2753  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 416 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.853922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  28.07 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  22.29 
 
 		 455 aa  60.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  24.51 
 
 		 393 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  26.34 
 
 		 629 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  27.91 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.49 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.06 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  24.51 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  25.56 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4015  hypothetical protein  26.04 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.56 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>