133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1840 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1840  membrane-fusion protein  100 
 
 		 429 aa  883    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2737  membrane-fusion protein  68.41 
 
 		 420 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1902  membrane-fusion protein  67.33 
 
 		 419 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0558652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1471  membrane-fusion protein  60.84 
 
 		 400 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7080  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23 
 
 		 416 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1839  membrane-fusion protein  23.32 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00691456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1470  membrane-fusion protein  22.22 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2738  membrane-fusion protein  21.09 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1901  secretion protein HlyD family protein  20.85 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.807091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.36 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.43 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  23.82 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.25 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.94 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  25.23 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  27.39 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  27.11 
 
 		 397 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  21.39 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  21.47 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  23.59 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  24.72 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3508  secretion protein HlyD  26.78 
 
 		 460 aa  53.1  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  22.53 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  28.19 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.17 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  21.43 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.58 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  20.11 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.51 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  24.56 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 351 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  24.67 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.88 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  24.46 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  24.58 
 
 		 382 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  23.97 
 
 		 435 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0283  RND family efflux transporter MFP subunit  21.99 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  24.4 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  22.13 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  24.91 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  22.95 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.22 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  24.24 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  22.71 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.57 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  18.59 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.5 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  24.18 
 
 		 353 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  24.78 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  20.78 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  24.06 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  25.11 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 		 517 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 517 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  22.69 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  25.22 
 
 		 349 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  25.81 
 
 		 351 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  21.52 
 
 		 384 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2740  secretion protein HlyD  23.46 
 
 		 462 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  22.13 
 
 		 366 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2739  multidrug resistance efflux pump-like protein  22.29 
 
 		 343 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003811  membrane-fusion protein  22.22 
 
 		 343 aa  46.6  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.79 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  23.71 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  24.14 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  31.88 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  24.06 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  23.71 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  23.71 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  23.71 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  23.36 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  22.65 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1615  RND family efflux transporter MFP subunit  24.2 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000338384  decreased coverage  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  25.21 
 
 		 641 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  21.58 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  30.14 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  26.52 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  22.55 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  22.88 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  22.5 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.87 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  23.28 
 
 		 489 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  23.71 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3642  putative cation efflux system protein cusB precursor  20.89 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  24.44 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  22.84 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  25.88 
 
 		 578 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  35.94 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  22.65 
 
 		 504 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  35.14 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2865  HlyD family secretion protein  21.74 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>