More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2093 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  100 
 
 		 428 aa  842    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  57.48 
 
 		 434 aa  471  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  46.23 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  43.82 
 
 		 439 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  45.5 
 
 		 607 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  43.19 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  46.38 
 
 		 399 aa  329  7e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  46.1 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  42.59 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  44.9 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  44.66 
 
 		 438 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  42.14 
 
 		 414 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  41.69 
 
 		 408 aa  296  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  43.58 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  39.43 
 
 		 479 aa  273  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  37.47 
 
 		 474 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  38.11 
 
 		 361 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  35.8 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  34.67 
 
 		 366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  28.64 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  31.15 
 
 		 517 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25.06 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  29.12 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.77 
 
 		 504 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  30.69 
 
 		 339 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  28.5 
 
 		 305 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  30.56 
 
 		 304 aa  90.5  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  32.28 
 
 		 294 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  32.28 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  30 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.39 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  30 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  30 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  26.38 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  32.75 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  34.81 
 
 		 298 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.51 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  26.5 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.82 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  26.34 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.32 
 
 		 335 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.96 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2645  hypothetical protein  26.27 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.71 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.31 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.31 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.53 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  28.69 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  28.69 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  51.47 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  25.74 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  26.85 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.89 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  25.88 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  29.51 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  23.2 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  25.57 
 
 		 344 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.66 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  26.07 
 
 		 333 aa  57  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  26.32 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  27.14 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 		 586 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  28.74 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  28.74 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  23.91 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  28 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  28.65 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  24.24 
 
 		 431 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  25.25 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  28.74 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  28.12 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  24.5 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  28.48 
 
 		 567 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 503 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  28.66 
 
 		 371 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.66 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  26.49 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  45.83 
 
 		 334 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  28.66 
 
 		 371 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  22.41 
 
 		 353 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  30 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  24.5 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.16 
 
 		 285 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 		 329 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.07 
 
 		 481 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  25.22 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  22.19 
 
 		 607 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  26.49 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  29.63 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.72 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>