174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1252 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  100 
 
 		 304 aa  598  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  68.94 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  59.52 
 
 		 294 aa  328  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  47.85 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  53.31 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  52.53 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  48.22 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  47.83 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  48.22 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  47.43 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  33.99 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  28.72 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  38.51 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  37.84 
 
 		 438 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  37.16 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  27.61 
 
 		 399 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  38.46 
 
 		 399 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  38.73 
 
 		 474 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  27.65 
 
 		 414 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  26.6 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  29.49 
 
 		 401 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  36.73 
 
 		 434 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  26.97 
 
 		 361 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  27.65 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  29.02 
 
 		 479 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  36.97 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  30.32 
 
 		 428 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  24.09 
 
 		 408 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  36.97 
 
 		 406 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  32.59 
 
 		 607 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  27.31 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.38 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  27.23 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  26.28 
 
 		 390 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  27.39 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1316  RND family efflux transporter MFP subunit  28.28 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0457326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.19 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1246  RND family efflux transporter MFP subunit  28.43 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  25.24 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  24.83 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  25.7 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  30.08 
 
 		 458 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.49 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 505 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.33 
 
 		 458 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 406 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.69 
 
 		 407 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 406 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.89 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.76 
 
 		 410 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  29.27 
 
 		 466 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  24.54 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 		 416 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  23.74 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 		 416 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  24.3 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 413 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  24.27 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  24.5 
 
 		 430 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2973  RND family efflux transporter MFP subunit  27.91 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.388324  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  21.65 
 
 		 394 aa  49.3  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.12 
 
 		 354 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  27.17 
 
 		 267 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  23.96 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1390  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 		 575 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  24.31 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3131  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.419387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  26.14 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2987  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.331807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.36 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3222  secretion protein HlyD  27.18 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  24.17 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.17 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  23.61 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  23.94 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  26.34 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2635  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 370 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0171634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3720  RND family efflux pump membrane fusion protein  26.67 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0718738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  28.1 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  22.84 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 		 438 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 419 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  24.42 
 
 		 407 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  23.73 
 
 		 414 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  26.59 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  22.9 
 
 		 399 aa  47  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  21.01 
 
 		 390 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.81 
 
 		 392 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  24.39 
 
 		 353 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.88 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  21.97 
 
 		 421 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>