More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2731 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  100 
 
 		 607 aa  1229    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  46.65 
 
 		 439 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  45.5 
 
 		 428 aa  336  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  45.11 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  44.95 
 
 		 399 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  45.67 
 
 		 438 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  45.14 
 
 		 479 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  44.47 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  45.8 
 
 		 438 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  45.91 
 
 		 399 aa  310  6.999999999999999e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  42.59 
 
 		 406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  43.23 
 
 		 400 aa  306  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  42.14 
 
 		 414 aa  303  6.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  43.13 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  40.14 
 
 		 408 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  41.75 
 
 		 399 aa  273  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  36.34 
 
 		 361 aa  243  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  36.58 
 
 		 398 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  32.39 
 
 		 366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  27.5 
 
 		 401 aa  147  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.68 
 
 		 504 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  40.16 
 
 		 303 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  36.64 
 
 		 339 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 517 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  29.76 
 
 		 305 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.87 
 
 		 496 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.47 
 
 		 496 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  29.27 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  36.22 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  36.22 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  32.59 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  23.55 
 
 		 345 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  35.43 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  31.5 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.43 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  37.8 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  24.32 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  26.23 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  29.69 
 
 		 346 aa  67  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.6 
 
 		 426 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  25.18 
 
 		 353 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  24.21 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  24.18 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  24.87 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  27.54 
 
 		 317 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.83 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  27.33 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  32.65 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.95 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  23.1 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  25.81 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  29.55 
 
 		 358 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 368 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  27.2 
 
 		 368 aa  60.1  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.27 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  25.67 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  25.75 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  33.33 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  23.94 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  29.94 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  27.52 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  26.29 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  23.79 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.38 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  26.29 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  26.29 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 398 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 400 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  25.72 
 
 		 393 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  26.74 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  22.86 
 
 		 504 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  28.74 
 
 		 360 aa  56.2  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  31.19 
 
 		 314 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  25.24 
 
 		 329 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  26.44 
 
 		 352 aa  55.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.56 
 
 		 516 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  26.38 
 
 		 343 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 364 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 487 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  24.56 
 
 		 400 aa  54.7  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  23.41 
 
 		 391 aa  54.7  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  25.44 
 
 		 425 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  26.9 
 
 		 323 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  26.38 
 
 		 343 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  26.38 
 
 		 343 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 487 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  22.88 
 
 		 347 aa  54.3  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  26.38 
 
 		 343 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.94 
 
 		 516 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  26.38 
 
 		 343 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 364 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  26.38 
 
 		 343 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  26.38 
 
 		 343 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  24.23 
 
 		 394 aa  53.9  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 364 aa  53.9  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>