More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0330 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  100 
 
 		 398 aa  794    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  38.9 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  40.26 
 
 		 399 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  36.68 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  40.46 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  38.68 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  37.35 
 
 		 438 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  37.35 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  37.19 
 
 		 414 aa  223  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  36.3 
 
 		 439 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  35.8 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  39.02 
 
 		 399 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  37.08 
 
 		 479 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  35.73 
 
 		 408 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  36.58 
 
 		 607 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  33.86 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  36.75 
 
 		 406 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  39.37 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  28.61 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  26.83 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  26.33 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  26.33 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  25.74 
 
 		 303 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  24.11 
 
 		 339 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  27.65 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 517 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  26.39 
 
 		 345 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  24.7 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  31.21 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  26.88 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.8 
 
 		 496 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.4 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.09 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  29.08 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  28.25 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.05 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  27.65 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  28.37 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  28.37 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  27.92 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  28.37 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  28.37 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  24.84 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  28.15 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  26.43 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  29.1 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  28.37 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.89 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  27.56 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  29.34 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  25.47 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  31.67 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  31.67 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.73 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  31.67 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  27.41 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0942  putative secretion protein, HlyD family  27.45 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  30.52 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  29.1 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.26 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  28.96 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27.86 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  28.8 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.35 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  27.33 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  28.71 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  30.42 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  28 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  28 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  27.03 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  28 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  28.02 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  28 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  28 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  28 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  28 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.68 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  25.77 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  26.58 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  27.1 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  30.21 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  23.91 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  23.96 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.34 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  27.64 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  27.17 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.38 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>