More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4103 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  100 
 
 		 408 aa  815    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  43.64 
 
 		 399 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  45.97 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  44.76 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  43.84 
 
 		 399 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  41.69 
 
 		 428 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  43.01 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  40.14 
 
 		 607 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  41.71 
 
 		 444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  41.31 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  38.64 
 
 		 438 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  38.64 
 
 		 438 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  39.45 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  40.23 
 
 		 414 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  43.14 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  33.98 
 
 		 479 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  35.73 
 
 		 398 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  32.55 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  35.41 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  27.03 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  28.22 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  26.3 
 
 		 294 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  22.19 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  22.45 
 
 		 305 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  24.09 
 
 		 304 aa  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 		 352 aa  88.2  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  29.6 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.08 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  33.61 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  32.28 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  32.28 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  27.56 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  32.77 
 
 		 304 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  30.94 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.49 
 
 		 500 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.61 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  25.59 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  26.37 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  26.02 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.08 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  29 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.67 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  24.01 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  25.31 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.24 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  25.19 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  28.29 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  23.99 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  23.33 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  24.38 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  25.5 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.47 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  22.59 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.63 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  29.92 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  26.07 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.6 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  25.95 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  24.79 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  23.69 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  26.3 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.61 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.18 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.15 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  24.77 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  24.58 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.89 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.13 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.07 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.07 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  23.11 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.04 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  27.56 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  22.73 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.7 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  27.65 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  24.71 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  25.16 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  25.98 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  23.67 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1840  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.772932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3340  secretion protein HlyD family protein  31.36 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  26.77 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.52 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  29.81 
 
 		 285 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.28 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2645  hypothetical protein  23.79 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>