104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_08081 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  100 
 
 		 304 aa  597  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  94.74 
 
 		 304 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  91.12 
 
 		 304 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  76.25 
 
 		 303 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  50.39 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  50.52 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  46.62 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  47.83 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  46.89 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  46.27 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  26.07 
 
 		 366 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  26.49 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  23.92 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  39.39 
 
 		 399 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  38.52 
 
 		 439 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  33.01 
 
 		 438 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  33.01 
 
 		 438 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  35.21 
 
 		 474 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  25.41 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  37.82 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  36.22 
 
 		 607 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  34.78 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  38.66 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  32.77 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  29.58 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  30 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  29.08 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  34.45 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  35.29 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  32.69 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  20.86 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  22.57 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  23.83 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  25.2 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  25.76 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  28.11 
 
 		 417 aa  49.7  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  23.13 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  25.81 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  21.84 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.61 
 
 		 365 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  27.78 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  28.32 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3340  secretion protein HlyD family protein  37.21 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  28.32 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  21.61 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 424 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  24.26 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 405 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  30.43 
 
 		 509 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.48 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  23.6 
 
 		 405 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 		 354 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 424 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2645  hypothetical protein  22.52 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0374  Multidrug resistance efflux pump-like protein  24.77 
 
 		 271 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.68 
 
 		 453 aa  45.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 		 432 aa  45.8  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  28 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  31.4 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  27.61 
 
 		 433 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2353  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  28.32 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  22.98 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4015  hypothetical protein  24.11 
 
 		 435 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  27.72 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  24.32 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3735  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  23.43 
 
 		 435 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0627  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 		 405 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  23.36 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0650  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.45 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  24.47 
 
 		 375 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  22.96 
 
 		 414 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  26.98 
 
 		 727 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.99 
 
 		 434 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  27.34 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  25.36 
 
 		 388 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  21.2 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.79 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  23.69 
 
 		 406 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  24.09 
 
 		 420 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3255  RND family efflux transporter MFP subunit  21.74 
 
 		 388 aa  42.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  23.16 
 
 		 430 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  24.53 
 
 		 367 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  27.88 
 
 		 402 aa  42.7  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  30 
 
 		 368 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>