More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2645 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2645  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  46.73 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  24.29 
 
 		 345 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  27.96 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  27.85 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  24.64 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1176  hypothetical protein  26.03 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0174847  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0750  hypothetical protein  26.03 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1051  hypothetical protein  26.03 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  25.69 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  24.32 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  22.48 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.01 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  25.29 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  28.87 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  24.74 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  23.26 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  27.07 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  26.9 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.24 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  26.27 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  26.69 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  32.6 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  23.67 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  23.74 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  24.89 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.7 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.63 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.5 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  27.15 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  27.55 
 
 		 402 aa  62  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  24.11 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  27.56 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  26.46 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.16 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  26.13 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.14 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.77 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  23.15 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  25.1 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  25.51 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  25.79 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  25.51 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  25.1 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  25.51 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.51 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.51 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  25.1 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  25.1 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.71 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  23.44 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  24.76 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  25.71 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  25.71 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.71 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0341  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.666034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  25.4 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  25.29 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  23.08 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.7 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  25.21 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  25.4 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6029  acriflavin resistance protein A  23.89 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  23.14 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  25.2 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.97 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.83 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.45 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  23.2 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0374  Multidrug resistance efflux pump-like protein  24.12 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  25.76 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  25.66 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  24.53 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  22.43 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  24.02 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  24.35 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  26.63 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2730  secretion protein HlyD  23.59 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299945  normal  0.0908172 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  23.42 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1097 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  22.69 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>