177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3968 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  100 
 
 		 727 aa  1483    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  25.5 
 
 		 578 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  26.01 
 
 		 611 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  25.09 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  25.48 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  25.85 
 
 		 371 aa  63.9  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  26.22 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  29.67 
 
 		 442 aa  60.1  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  30 
 
 		 366 aa  60.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  27.84 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  25.09 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2570  hypothetical protein  32.3 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  26.9 
 
 		 359 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2051  RND family efflux transporter MFP subunit  32.74 
 
 		 364 aa  56.6  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0552963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  34.72 
 
 		 374 aa  55.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  27.84 
 
 		 442 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  28.17 
 
 		 335 aa  55.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  27.43 
 
 		 387 aa  54.7  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  36 
 
 		 358 aa  54.3  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  28.17 
 
 		 335 aa  54.3  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  24.77 
 
 		 631 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5851  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.17 
 
 		 369 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.85 
 
 		 347 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  31.85 
 
 		 311 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  25.15 
 
 		 436 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0569  secretion protein HlyD family protein  25.81 
 
 		 267 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  24.63 
 
 		 353 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2624  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 357 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  26.74 
 
 		 439 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  26.19 
 
 		 436 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  31.85 
 
 		 311 aa  53.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  33.01 
 
 		 364 aa  53.5  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0474  hypothetical protein  24.15 
 
 		 267 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0145  hypothetical protein  31.76 
 
 		 259 aa  52  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  29.06 
 
 		 345 aa  52  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0388  hypothetical protein  27.85 
 
 		 283 aa  51.6  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.338994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0420  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  31.21 
 
 		 311 aa  51.6  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.29 
 
 		 357 aa  51.2  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2054  secretion protein HlyD family protein  30.46 
 
 		 263 aa  50.8  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 407 aa  50.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  29.7 
 
 		 351 aa  50.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  31.3 
 
 		 360 aa  50.8  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 373 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  29.27 
 
 		 294 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  28.78 
 
 		 343 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4621  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 386 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  28.78 
 
 		 343 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  24.5 
 
 		 425 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.4 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  23.78 
 
 		 627 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  36.52 
 
 		 404 aa  49.7  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 		 418 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  25.93 
 
 		 286 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  29.27 
 
 		 359 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  40.91 
 
 		 319 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  28.78 
 
 		 343 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  28.78 
 
 		 343 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  36.67 
 
 		 343 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  28.78 
 
 		 343 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  29.82 
 
 		 358 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  28.78 
 
 		 343 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  26.32 
 
 		 346 aa  49.3  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  28.78 
 
 		 343 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  23.92 
 
 		 381 aa  49.3  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1316  RND family efflux transporter MFP subunit  32.64 
 
 		 373 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0457326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  27.33 
 
 		 714 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  32.67 
 
 		 365 aa  48.9  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2400  GAF domain-containing protein  21.79 
 
 		 628 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0477  hypothetical protein  25.81 
 
 		 268 aa  49.3  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371945  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  28.78 
 
 		 343 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1246  RND family efflux transporter MFP subunit  32.64 
 
 		 373 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  32.43 
 
 		 342 aa  48.5  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  40.91 
 
 		 319 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4144  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 		 365 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.473768 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  33.66 
 
 		 357 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.04 
 
 		 380 aa  48.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 		 366 aa  48.5  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.390239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  29.45 
 
 		 408 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  26.22 
 
 		 366 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.5 
 
 		 357 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  26.49 
 
 		 376 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  28 
 
 		 304 aa  47.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  43.86 
 
 		 621 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  24.12 
 
 		 451 aa  47.4  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  25.31 
 
 		 285 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1962  RND family efflux transporter MFP subunit  27.94 
 
 		 393 aa  47.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 		 360 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.31 
 
 		 285 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 		 360 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  26.94 
 
 		 302 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0673  multidrug resistance protein  25.62 
 
 		 354 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  28.57 
 
 		 357 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  25.31 
 
 		 285 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  25.71 
 
 		 419 aa  47.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  29.2 
 
 		 357 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  26.94 
 
 		 302 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  27.83 
 
 		 466 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  29.88 
 
 		 351 aa  47.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  25.31 
 
 		 285 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>