281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0926 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  100 
 
 		 614 aa  1254    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1341  putative phytochrome sensor protein  38.1 
 
 		 612 aa  363  6e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  34.57 
 
 		 627 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0618  putative phytochrome sensor protein  37.05 
 
 		 615 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2400  GAF domain-containing protein  34.93 
 
 		 628 aa  331  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  34.41 
 
 		 611 aa  302  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  33.22 
 
 		 578 aa  293  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  29.98 
 
 		 631 aa  203  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  29.19 
 
 		 619 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  28 
 
 		 442 aa  87.4  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  30.12 
 
 		 442 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  30.12 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  29.96 
 
 		 439 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  28.76 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2759  hypothetical protein  22.63 
 
 		 681 aa  75.1  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  23.74 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  29.69 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3663  hypothetical protein  27.13 
 
 		 343 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  25 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  24.78 
 
 		 727 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  28.57 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  29.49 
 
 		 376 aa  63.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  29.81 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.82 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  30.52 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  29.27 
 
 		 447 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.19 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  26.76 
 
 		 360 aa  56.6  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 398 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.48 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1862  hypothetical protein  26.28 
 
 		 865 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 663 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1836  hypothetical protein  26.28 
 
 		 865 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 360 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  25 
 
 		 1097 aa  55.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  24.35 
 
 		 451 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  27.89 
 
 		 709 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  25.89 
 
 		 451 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  26.46 
 
 		 709 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  30.33 
 
 		 383 aa  55.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  27.81 
 
 		 349 aa  54.7  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  27.95 
 
 		 389 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  30.33 
 
 		 383 aa  54.7  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  27.14 
 
 		 446 aa  54.3  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  24.77 
 
 		 407 aa  54.3  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.22 
 
 		 347 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 437 aa  54.3  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  24.4 
 
 		 436 aa  54.3  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 		 430 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  30.19 
 
 		 352 aa  53.9  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 		 399 aa  53.9  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 		 430 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  25.22 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  31.51 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.91 
 
 		 354 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  27.05 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0341  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.666034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 380 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 		 383 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  26.64 
 
 		 360 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 		 387 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  25.65 
 
 		 360 aa  52.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  24.81 
 
 		 418 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1418  RND family efflux transporter MFP subunit  31.96 
 
 		 384 aa  52.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267918  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2230  RND family efflux transporter MFP subunit  29.66 
 
 		 362 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  27.18 
 
 		 380 aa  51.6  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  26.45 
 
 		 383 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  29.2 
 
 		 368 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.19 
 
 		 608 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 		 335 aa  51.2  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 351 aa  51.2  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  25.95 
 
 		 359 aa  51.2  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  28.42 
 
 		 366 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5274  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 		 377 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0726879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.51 
 
 		 360 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.22 
 
 		 455 aa  50.8  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 340 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 369 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 		 372 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  28.5 
 
 		 389 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 		 369 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 		 335 aa  50.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.5 
 
 		 370 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.32 
 
 		 310 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  25.48 
 
 		 356 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 310 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  28.65 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  24.46 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  25.49 
 
 		 471 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  27.16 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  27.78 
 
 		 366 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>