82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0146 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  865    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  70.84 
 
 		 439 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  62.93 
 
 		 439 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  63.16 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  61.76 
 
 		 442 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  61.09 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  41.11 
 
 		 457 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  37.47 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  39.72 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  36.32 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  36.44 
 
 		 490 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  38.53 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  38.39 
 
 		 448 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  37.1 
 
 		 449 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  32.41 
 
 		 450 aa  243  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  37.83 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  38.16 
 
 		 442 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  32.58 
 
 		 441 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  29.06 
 
 		 614 aa  77  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  30.45 
 
 		 611 aa  66.6  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  25.98 
 
 		 631 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  26.02 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.41 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2177  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.95 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.795187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  28.05 
 
 		 727 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  25.21 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  22.58 
 
 		 578 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  25.53 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  33.91 
 
 		 302 aa  50.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  27.36 
 
 		 394 aa  50.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  29.88 
 
 		 715 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  27.98 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  27.98 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  29.02 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 523 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  29.02 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  29.01 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  28.26 
 
 		 619 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.46 
 
 		 285 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  36.49 
 
 		 522 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0474  hypothetical protein  29.31 
 
 		 267 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  28.85 
 
 		 291 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  26.26 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  30.34 
 
 		 265 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 		 288 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  30.83 
 
 		 299 aa  46.6  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2759  hypothetical protein  24.73 
 
 		 681 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172121  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  30.46 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.94 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.94 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  25.88 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  26.94 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  24.88 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0569  secretion protein HlyD family protein  28.45 
 
 		 267 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  29.21 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2400  GAF domain-containing protein  25.31 
 
 		 628 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  26.94 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  31.65 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  31.43 
 
 		 297 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5851  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.09 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  24.58 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  24.65 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 391 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  25.49 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.93 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  39.39 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 589 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  25.49 
 
 		 366 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  34.71 
 
 		 317 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4325  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 322 aa  43.5  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  32.53 
 
 		 368 aa  43.5  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  26.27 
 
 		 667 aa  43.5  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  20.61 
 
 		 701 aa  43.5  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  29.25 
 
 		 317 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.01 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>