53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0619 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  100 
 
 		 715 aa  1431    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  46.07 
 
 		 715 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  49.42 
 
 		 714 aa  668    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  46.35 
 
 		 715 aa  634  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  43.08 
 
 		 715 aa  624  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  41.12 
 
 		 721 aa  555  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  33.76 
 
 		 711 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  33.1 
 
 		 720 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  33.38 
 
 		 720 aa  364  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  28.47 
 
 		 741 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  25.76 
 
 		 719 aa  180  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  28.14 
 
 		 709 aa  160  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  27.07 
 
 		 696 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  25.57 
 
 		 703 aa  156  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  29.33 
 
 		 736 aa  147  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  30.17 
 
 		 709 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  27.61 
 
 		 701 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  30.87 
 
 		 474 aa  143  9e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  24.66 
 
 		 702 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  29.55 
 
 		 688 aa  141  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  25.47 
 
 		 701 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  26.4 
 
 		 698 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  26.39 
 
 		 720 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  26.57 
 
 		 697 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  28.32 
 
 		 709 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  25.62 
 
 		 707 aa  134  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  23.81 
 
 		 714 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  29.21 
 
 		 699 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  25 
 
 		 701 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  28.39 
 
 		 1124 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  24.13 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  27.45 
 
 		 1177 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 		 1171 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 		 948 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  26.16 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  23.85 
 
 		 741 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  29.05 
 
 		 847 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  29.05 
 
 		 844 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  29.05 
 
 		 847 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  24.73 
 
 		 350 aa  57.4  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  25.82 
 
 		 838 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  31.25 
 
 		 824 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  29.05 
 
 		 825 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  29.55 
 
 		 238 aa  51.2  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  26.82 
 
 		 413 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  28.86 
 
 		 436 aa  48.9  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  26.9 
 
 		 398 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  26.4 
 
 		 439 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  25.81 
 
 		 446 aa  45.8  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  27.3 
 
 		 812 aa  45.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2265  hypothetical protein  28.78 
 
 		 413 aa  45.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.68 
 
 		 663 aa  44.3  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  31.06 
 
 		 439 aa  44.3  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>