23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0371 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  914    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  39.33 
 
 
436 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  39.87 
 
 
439 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  40.93 
 
 
439 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  37.5 
 
 
446 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  38.63 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  38.24 
 
 
436 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  36.56 
 
 
446 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  34.33 
 
 
490 aa  262  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  34.73 
 
 
450 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  37.19 
 
 
442 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  36.59 
 
 
442 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  38.01 
 
 
442 aa  249  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  37.22 
 
 
448 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  36.43 
 
 
451 aa  239  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  36.14 
 
 
449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  37.13 
 
 
451 aa  230  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  35.84 
 
 
441 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  23.86 
 
 
619 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  25.9 
 
 
631 aa  53.5  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0618  putative phytochrome sensor protein  24.53 
 
 
615 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  22.55 
 
 
707 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  22.22 
 
 
334 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>