60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0390 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  63.18 
 
 		 698 aa  861    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  61.66 
 
 		 697 aa  809    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  82.45 
 
 		 701 aa  1144    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  100 
 
 		 707 aa  1424    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  79.23 
 
 		 702 aa  1126    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  77.36 
 
 		 701 aa  1089    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  39.72 
 
 		 709 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  39.64 
 
 		 709 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  39.03 
 
 		 714 aa  465  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  38.74 
 
 		 709 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  35.64 
 
 		 719 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  36.43 
 
 		 703 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  37.74 
 
 		 688 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  38.21 
 
 		 701 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  35.32 
 
 		 720 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  35.45 
 
 		 696 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  39.19 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  34.75 
 
 		 699 aa  343  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  27.13 
 
 		 720 aa  183  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  27.63 
 
 		 715 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  25.42 
 
 		 741 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  25.32 
 
 		 714 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  27.16 
 
 		 715 aa  154  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  27.34 
 
 		 715 aa  150  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  28.71 
 
 		 711 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  25.61 
 
 		 721 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  25.62 
 
 		 715 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  26.32 
 
 		 736 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  25.13 
 
 		 720 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  26.21 
 
 		 367 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  35.81 
 
 		 1171 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  32.62 
 
 		 1177 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  30.59 
 
 		 825 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  24.35 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  27.51 
 
 		 1124 aa  75.5  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0373  hypothetical protein  27.17 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.5146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  28.57 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  31.33 
 
 		 847 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  31.33 
 
 		 844 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  31.33 
 
 		 838 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  31.33 
 
 		 847 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  29.52 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 948 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  29.61 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  31.69 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  28.97 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  27.27 
 
 		 449 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  31.34 
 
 		 497 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  25.61 
 
 		 761 aa  54.3  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  25.59 
 
 		 441 aa  51.2  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  32.18 
 
 		 176 aa  50.8  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1097 aa  48.9  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  37.93 
 
 		 235 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  27.23 
 
 		 741 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  31.09 
 
 		 418 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148727  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  27.44 
 
 		 756 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  25.44 
 
 		 371 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  31.33 
 
 		 518 aa  44.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3123  hypothetical protein  26.06 
 
 		 248 aa  44.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>