40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3142 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  100 
 
 		 761 aa  1441    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  41.83 
 
 		 838 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  41.97 
 
 		 825 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  39.37 
 
 		 847 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  39.37 
 
 		 847 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  40.78 
 
 		 844 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  39.19 
 
 		 824 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  42.31 
 
 		 812 aa  239  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  37.39 
 
 		 497 aa  237  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  23.84 
 
 		 413 aa  91.3  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  32.46 
 
 		 719 aa  70.5  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  25.33 
 
 		 235 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  27.59 
 
 		 709 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  28.11 
 
 		 709 aa  63.9  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  27.17 
 
 		 714 aa  59.7  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  28.96 
 
 		 699 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  23.95 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  26.01 
 
 		 702 aa  58.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  31.43 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  26.18 
 
 		 701 aa  57.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  32.62 
 
 		 688 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  32.17 
 
 		 720 aa  56.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  27.4 
 
 		 715 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  25.73 
 
 		 707 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  29.1 
 
 		 697 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  31.2 
 
 		 703 aa  55.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  28.12 
 
 		 720 aa  54.7  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  26.47 
 
 		 709 aa  54.7  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  22.87 
 
 		 701 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  25.73 
 
 		 698 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  29.44 
 
 		 696 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  29.68 
 
 		 736 aa  51.2  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  27.81 
 
 		 1124 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  30.08 
 
 		 701 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  32.65 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  26.88 
 
 		 715 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  28.14 
 
 		 367 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  30.22 
 
 		 715 aa  45.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  25.26 
 
 		 720 aa  44.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  24.91 
 
 		 714 aa  43.9  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>