54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2358 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  46.35 
 
 		 715 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  95.24 
 
 		 715 aa  1350    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  100 
 
 		 715 aa  1422    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  44.35 
 
 		 715 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  43.63 
 
 		 714 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  38.97 
 
 		 721 aa  509  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  38.4 
 
 		 711 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  34.21 
 
 		 720 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  34.13 
 
 		 720 aa  360  6e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  32.23 
 
 		 741 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  25.69 
 
 		 719 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  30.39 
 
 		 736 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  27.44 
 
 		 701 aa  163  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  26.52 
 
 		 702 aa  162  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  25.91 
 
 		 714 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  27.69 
 
 		 707 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  25.58 
 
 		 709 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  26.21 
 
 		 701 aa  154  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  27.19 
 
 		 688 aa  153  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  28.25 
 
 		 696 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  24.21 
 
 		 703 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  29.06 
 
 		 709 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  26.03 
 
 		 709 aa  144  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  30.35 
 
 		 720 aa  144  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  24.85 
 
 		 698 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  28.54 
 
 		 699 aa  137  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  30.9 
 
 		 474 aa  135  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  25.35 
 
 		 701 aa  133  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  26.75 
 
 		 697 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 1124 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  26.38 
 
 		 367 aa  98.6  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  29.81 
 
 		 1177 aa  84.7  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  30.23 
 
 		 1171 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  28.32 
 
 		 948 aa  74.7  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  29.9 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  24.71 
 
 		 741 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  26.04 
 
 		 176 aa  66.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  25.25 
 
 		 350 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  26.39 
 
 		 838 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  27.33 
 
 		 825 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  28.15 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  24.92 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  24.92 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  24.92 
 
 		 844 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  26.94 
 
 		 824 aa  57.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2431  peptidase M50  25.66 
 
 		 410 aa  55.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0730109  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  33.86 
 
 		 238 aa  54.3  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  27.4 
 
 		 761 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  27.21 
 
 		 756 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  27.66 
 
 		 812 aa  47.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  30.65 
 
 		 441 aa  47.4  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  26.9 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  27.4 
 
 		 497 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  31.82 
 
 		 357 aa  43.9  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>