50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2176 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  100 
 
 		 721 aa  1461    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  41.83 
 
 		 715 aa  569  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  40.41 
 
 		 715 aa  572  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  40.9 
 
 		 714 aa  538  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  38.76 
 
 		 715 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  39.17 
 
 		 715 aa  515  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  29.92 
 
 		 711 aa  354  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  31.15 
 
 		 720 aa  337  5.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  31.89 
 
 		 720 aa  323  5e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  31.17 
 
 		 741 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  26.16 
 
 		 709 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  25.45 
 
 		 702 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  25.86 
 
 		 709 aa  158  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  25.37 
 
 		 701 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  26.4 
 
 		 707 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  26.06 
 
 		 696 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  25.44 
 
 		 701 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  26.68 
 
 		 698 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  27.27 
 
 		 736 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  24.37 
 
 		 719 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  24.48 
 
 		 701 aa  134  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  26.57 
 
 		 688 aa  128  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  23.5 
 
 		 714 aa  124  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  24.45 
 
 		 709 aa  124  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  25.19 
 
 		 703 aa  124  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  26.34 
 
 		 720 aa  114  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  25.36 
 
 		 697 aa  114  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  25.5 
 
 		 474 aa  112  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  24.15 
 
 		 699 aa  101  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  26.28 
 
 		 1124 aa  93.2  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  27.54 
 
 		 367 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  25.29 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  23.64 
 
 		 1177 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  23.55 
 
 		 847 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  23.55 
 
 		 847 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  23.55 
 
 		 844 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  23.31 
 
 		 838 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  25.33 
 
 		 1171 aa  63.9  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  27.27 
 
 		 825 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  23.7 
 
 		 350 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  24.05 
 
 		 824 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  22.82 
 
 		 741 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  21.76 
 
 		 948 aa  54.7  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  26.81 
 
 		 238 aa  54.7  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  23.55 
 
 		 398 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  24.85 
 
 		 413 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  27.33 
 
 		 448 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  28.1 
 
 		 812 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  22.78 
 
 		 446 aa  44.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2265  hypothetical protein  28.79 
 
 		 413 aa  44.3  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>