76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0479 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  60.83 
 
 		 698 aa  829    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  75.46 
 
 		 701 aa  1061    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  59.74 
 
 		 697 aa  789    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  100 
 
 		 701 aa  1399    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  82.45 
 
 		 707 aa  1164    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  76.64 
 
 		 702 aa  1089    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  39.72 
 
 		 714 aa  479  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  39.23 
 
 		 709 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  39.66 
 
 		 709 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  37.2 
 
 		 719 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  39.49 
 
 		 709 aa  435  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  37.45 
 
 		 701 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  37.68 
 
 		 688 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  34.42 
 
 		 703 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  35.23 
 
 		 720 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  35.64 
 
 		 696 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  41.08 
 
 		 474 aa  359  8e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  34.65 
 
 		 699 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  27.61 
 
 		 741 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  28.45 
 
 		 720 aa  171  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  27.8 
 
 		 715 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  25.36 
 
 		 714 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  25.62 
 
 		 715 aa  153  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  27.55 
 
 		 715 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  27.34 
 
 		 711 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  25.44 
 
 		 721 aa  133  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  25 
 
 		 715 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  27 
 
 		 736 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  25.46 
 
 		 720 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  33.13 
 
 		 1171 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0373  hypothetical protein  29.44 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.5146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  26.02 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  30.82 
 
 		 1177 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  29.38 
 
 		 1124 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  23.99 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  35.88 
 
 		 825 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  30.66 
 
 		 948 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  35.11 
 
 		 838 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  28.67 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  33.59 
 
 		 844 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  33.59 
 
 		 847 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  33.59 
 
 		 847 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  29.67 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  33.08 
 
 		 824 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  31.14 
 
 		 398 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  29.17 
 
 		 379 aa  55.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  26.89 
 
 		 441 aa  55.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  26.54 
 
 		 176 aa  55.1  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  29.63 
 
 		 449 aa  54.3  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  30.92 
 
 		 497 aa  53.9  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  34.71 
 
 		 812 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1097 aa  52  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  28.5 
 
 		 337 aa  50.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  28.06 
 
 		 334 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  24.8 
 
 		 761 aa  50.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  29.9 
 
 		 291 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  26.06 
 
 		 404 aa  48.5  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  29.8 
 
 		 291 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  29.08 
 
 		 294 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  29.8 
 
 		 291 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  29.8 
 
 		 291 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 294 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 		 324 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  24.75 
 
 		 436 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  28.65 
 
 		 324 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 		 324 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  28.71 
 
 		 328 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 		 323 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 331 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  32.65 
 
 		 518 aa  45.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  26.85 
 
 		 305 aa  45.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  30.12 
 
 		 349 aa  45.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 322 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  27.14 
 
 		 327 aa  44.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  37.93 
 
 		 235 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 288 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>