54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3235 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  100 
 
 		 711 aa  1448    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  36.97 
 
 		 715 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  38.4 
 
 		 715 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  36.16 
 
 		 715 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  38.26 
 
 		 714 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  33.76 
 
 		 715 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  30.25 
 
 		 721 aa  338  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  30.47 
 
 		 720 aa  317  5e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  31.54 
 
 		 720 aa  287  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  25.65 
 
 		 741 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  24.18 
 
 		 719 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  26.39 
 
 		 714 aa  152  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  24.87 
 
 		 709 aa  148  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  29.81 
 
 		 736 aa  146  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  24.34 
 
 		 696 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  28.71 
 
 		 707 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  27.34 
 
 		 701 aa  144  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  25.42 
 
 		 698 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  24.49 
 
 		 703 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  26.62 
 
 		 701 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  25.6 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  25.04 
 
 		 701 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  26.99 
 
 		 709 aa  140  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  26.9 
 
 		 702 aa  140  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  25.55 
 
 		 688 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  24.35 
 
 		 709 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  27.82 
 
 		 697 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  25.89 
 
 		 720 aa  126  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  23.99 
 
 		 699 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  30.61 
 
 		 1177 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 1171 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  31.1 
 
 		 367 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  34.06 
 
 		 1124 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  27.65 
 
 		 176 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  23 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  28.33 
 
 		 238 aa  55.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 948 aa  54.3  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  23.25 
 
 		 350 aa  53.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1836  hypothetical protein  22.38 
 
 		 865 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1862  hypothetical protein  22.38 
 
 		 865 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2759  hypothetical protein  26.25 
 
 		 681 aa  50.8  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  31.54 
 
 		 756 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  25.15 
 
 		 838 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  28.57 
 
 		 824 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  24.72 
 
 		 413 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  26.47 
 
 		 825 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.1 
 
 		 496 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  21.93 
 
 		 844 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2038  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 		 482 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0373239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  21.93 
 
 		 847 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  21.93 
 
 		 847 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  29.57 
 
 		 427 aa  44.3  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  32.17 
 
 		 407 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3489  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 		 381 aa  44.3  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>