71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1407 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  100 
 
 		 720 aa  1459    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  41.43 
 
 		 720 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  33.98 
 
 		 715 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  33.7 
 
 		 715 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  32.59 
 
 		 715 aa  389  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  33.1 
 
 		 715 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  33.38 
 
 		 714 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  31.5 
 
 		 721 aa  320  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  30.47 
 
 		 711 aa  317  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  29.66 
 
 		 741 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  27.17 
 
 		 702 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  27.5 
 
 		 701 aa  195  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  27.72 
 
 		 719 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  27.43 
 
 		 714 aa  190  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  23.88 
 
 		 703 aa  186  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  27.26 
 
 		 698 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  27.13 
 
 		 707 aa  183  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  26.42 
 
 		 688 aa  181  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  27.7 
 
 		 709 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  27.92 
 
 		 709 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  25.78 
 
 		 699 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  28.8 
 
 		 697 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  28.18 
 
 		 701 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  28.87 
 
 		 474 aa  167  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  28.49 
 
 		 720 aa  167  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  26.41 
 
 		 696 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  27.02 
 
 		 709 aa  165  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  26.42 
 
 		 701 aa  161  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  28.51 
 
 		 736 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  26.45 
 
 		 367 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  35.45 
 
 		 1124 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  26.56 
 
 		 1177 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  30.96 
 
 		 1171 aa  80.9  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  27.36 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  28.47 
 
 		 413 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  28.99 
 
 		 838 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  25.84 
 
 		 948 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  62.4  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  25.44 
 
 		 176 aa  62.4  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  25.13 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  29.71 
 
 		 847 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  29.71 
 
 		 844 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  29.71 
 
 		 847 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  32.48 
 
 		 497 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  28.47 
 
 		 825 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  23.32 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  26.81 
 
 		 824 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  28.82 
 
 		 224 aa  54.3  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  28.82 
 
 		 224 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  28.24 
 
 		 224 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  28.24 
 
 		 224 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  28.24 
 
 		 224 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2265  hypothetical protein  27.09 
 
 		 413 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  28.24 
 
 		 224 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  28.24 
 
 		 224 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  28.24 
 
 		 224 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  28.24 
 
 		 224 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  30.29 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  27.65 
 
 		 224 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  28.24 
 
 		 224 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1836  hypothetical protein  22.05 
 
 		 865 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1862  hypothetical protein  22.05 
 
 		 865 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0535  hypothetical protein  36.36 
 
 		 222 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  29.13 
 
 		 761 aa  48.9  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  30.87 
 
 		 237 aa  47.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1740  hypothetical protein  26.34 
 
 		 443 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130481  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  30 
 
 		 812 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3230  sterol-regulatory element binding protein  37.93 
 
 		 171 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 351 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  29.57 
 
 		 351 aa  45.4  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  41.43 
 
 		 451 aa  44.3  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>