81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0300 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  47.86 
 
 		 709 aa  656    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  100 
 
 		 719 aa  1453    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  48.29 
 
 		 709 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  45.62 
 
 		 709 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  38.77 
 
 		 701 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  36.97 
 
 		 714 aa  462  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  36.48 
 
 		 707 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  35.47 
 
 		 702 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  37.38 
 
 		 698 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  37.57 
 
 		 701 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  37.55 
 
 		 697 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  35.42 
 
 		 701 aa  435  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  38.03 
 
 		 696 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  36.64 
 
 		 688 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  36.38 
 
 		 699 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  35.29 
 
 		 703 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  35.89 
 
 		 720 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  42.95 
 
 		 474 aa  392  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  27.71 
 
 		 720 aa  205  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  30.43 
 
 		 714 aa  200  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  26.26 
 
 		 715 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  24.18 
 
 		 711 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  26.15 
 
 		 715 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  26.16 
 
 		 715 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  25.86 
 
 		 715 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  25.14 
 
 		 741 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  27.32 
 
 		 720 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  24.37 
 
 		 721 aa  147  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  24.49 
 
 		 736 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  26.04 
 
 		 367 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0373  hypothetical protein  33.17 
 
 		 205 aa  99.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.5146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  30.73 
 
 		 1177 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  30.17 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  25.22 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  34.29 
 
 		 1124 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  29.61 
 
 		 1171 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  28.64 
 
 		 350 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  36.67 
 
 		 825 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  31.55 
 
 		 238 aa  76.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  34.71 
 
 		 844 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  37.5 
 
 		 838 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  34.71 
 
 		 847 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  30.14 
 
 		 824 aa  73.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  34.71 
 
 		 847 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  30.66 
 
 		 948 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  31.72 
 
 		 761 aa  72.4  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  28.94 
 
 		 812 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  30.83 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  27.27 
 
 		 176 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  28.28 
 
 		 368 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 360 aa  55.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3230  sterol-regulatory element binding protein  30.53 
 
 		 171 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  26.01 
 
 		 619 aa  53.9  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  26.55 
 
 		 380 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2759  hypothetical protein  24.62 
 
 		 681 aa  52.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 380 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  23.47 
 
 		 418 aa  51.2  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  28.09 
 
 		 440 aa  50.8  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.04 
 
 		 415 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  26.92 
 
 		 357 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  23.57 
 
 		 367 aa  47.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 514 aa  47.4  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.31 
 
 		 361 aa  47.4  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.29 
 
 		 374 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  25.69 
 
 		 417 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  23.5 
 
 		 450 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  29.41 
 
 		 371 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 383 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  23.38 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  26.34 
 
 		 378 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 371 aa  45.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  27.03 
 
 		 357 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  32.71 
 
 		 359 aa  45.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 		 376 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  36.21 
 
 		 235 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3513  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 360 aa  45.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0849  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 360 aa  45.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.880012  normal  0.445386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 360 aa  45.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 		 379 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  28.27 
 
 		 756 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.6 
 
 		 549 aa  43.9  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>