237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1836 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1836  hypothetical protein  100 
 
 		 865 aa  1759    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 865 aa  1759    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1097 aa  125  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 517 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  25.64 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  28.74 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.15 
 
 		 504 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3663  hypothetical protein  28.12 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  25.28 
 
 		 611 aa  65.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.23 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 421 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 421 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.18 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  33.05 
 
 		 382 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.19 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  27.8 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  25.67 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.14 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0618  putative phytochrome sensor protein  26.11 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  26.79 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.88 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2224  multidrug efflux pump, membrane fusion protein  24.61 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1379  secretion protein HlyD family protein  22.68 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  27.21 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  31.71 
 
 		 406 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.09 
 
 		 496 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0558  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 		 513 aa  57.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 		 481 aa  57.4  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0900  RND family efflux transporter MFP subunit  24.61 
 
 		 388 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  30.83 
 
 		 382 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  27.94 
 
 		 408 aa  57  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.14 
 
 		 397 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  29.94 
 
 		 369 aa  56.2  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  26.28 
 
 		 614 aa  56.2  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 365 aa  56.2  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 		 496 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.72 
 
 		 349 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.33 
 
 		 432 aa  55.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 365 aa  55.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 365 aa  55.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.35 
 
 		 416 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 		 332 aa  55.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 365 aa  55.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 365 aa  55.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 365 aa  55.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 365 aa  55.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 365 aa  55.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  23.47 
 
 		 373 aa  55.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.67 
 
 		 328 aa  55.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  20.71 
 
 		 450 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.67 
 
 		 328 aa  55.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 370 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  27.45 
 
 		 368 aa  54.7  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  26.28 
 
 		 490 aa  54.7  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 370 aa  54.7  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  25.85 
 
 		 360 aa  54.3  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 		 373 aa  54.7  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  28.67 
 
 		 417 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.6 
 
 		 360 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  26.38 
 
 		 335 aa  54.3  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 360 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  32.2 
 
 		 372 aa  53.5  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  31.65 
 
 		 410 aa  52.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 360 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 360 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 417 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  28 
 
 		 360 aa  52.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.05 
 
 		 405 aa  52  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.79 
 
 		 328 aa  52  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  28.35 
 
 		 381 aa  52  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  27.69 
 
 		 486 aa  52  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  22.38 
 
 		 711 aa  51.6  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 523 aa  51.6  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  26.97 
 
 		 419 aa  51.2  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 		 430 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.53 
 
 		 359 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2586  peptidase M50  26.92 
 
 		 398 aa  50.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0867548  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 403 aa  50.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.42 
 
 		 500 aa  51.2  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 		 372 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 		 425 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1334  secretion protein HlyD  28.04 
 
 		 497 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  23.93 
 
 		 489 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  28.18 
 
 		 382 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.53 
 
 		 508 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  25.31 
 
 		 424 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  23.97 
 
 		 421 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  24.2 
 
 		 621 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.18 
 
 		 400 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  24.36 
 
 		 500 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  28.93 
 
 		 331 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  28.93 
 
 		 331 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  28.93 
 
 		 331 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>