More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2177 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  100 
 
 		 611 aa  1226    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0618  putative phytochrome sensor protein  38.03 
 
 		 615 aa  334  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1341  putative phytochrome sensor protein  37.23 
 
 		 612 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2400  GAF domain-containing protein  35.77 
 
 		 628 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  35.89 
 
 		 627 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  34.41 
 
 		 614 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  29.85 
 
 		 578 aa  210  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  29.27 
 
 		 631 aa  205  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  32.27 
 
 		 619 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  26.01 
 
 		 727 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  27.8 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  27.91 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.93 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  30.93 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.12 
 
 		 608 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1836  hypothetical protein  25.28 
 
 		 865 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1862  hypothetical protein  25.28 
 
 		 865 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  26.83 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  22.95 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 		 356 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.64 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  26.64 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  32.1 
 
 		 621 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  29.08 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  29.17 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  24.88 
 
 		 353 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.78 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1097 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  29.36 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  29.2 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  29.11 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  25.58 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  29.39 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  28.95 
 
 		 396 aa  57  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  29.11 
 
 		 372 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  28.74 
 
 		 404 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.9 
 
 		 405 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  24.84 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  28.19 
 
 		 403 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2759  hypothetical protein  24.28 
 
 		 681 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172121  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  24.37 
 
 		 372 aa  55.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0151  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 		 348 aa  55.1  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.961169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  31.72 
 
 		 349 aa  55.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3663  hypothetical protein  27.36 
 
 		 343 aa  54.7  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  24.22 
 
 		 356 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  24.37 
 
 		 372 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 426 aa  54.3  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  29.47 
 
 		 381 aa  54.3  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 351 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 351 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 		 369 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 405 aa  54.3  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  25.31 
 
 		 451 aa  54.3  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 		 369 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 		 437 aa  53.9  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 		 369 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  22.64 
 
 		 353 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 		 369 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 417 aa  53.9  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.45 
 
 		 663 aa  53.9  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.31 
 
 		 481 aa  53.9  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  25.31 
 
 		 451 aa  53.9  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 352 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 364 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 379 aa  53.5  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  34.91 
 
 		 625 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  27.22 
 
 		 405 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  27.27 
 
 		 439 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.93 
 
 		 352 aa  53.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  26.83 
 
 		 421 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  20.7 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  27.44 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.45 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.43 
 
 		 379 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 352 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  29.28 
 
 		 366 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  25.97 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  27.85 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  24.46 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  27.04 
 
 		 459 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  26.36 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 		 358 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 409 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 352 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 		 388 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  39.52 
 
 		 401 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2261  secretion protein HlyD family protein  26.17 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0232169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>