111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0908 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  899    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  93.35 
 
 		 451 aa  798    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  60.85 
 
 		 442 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  43.68 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  41.5 
 
 		 449 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  40.6 
 
 		 436 aa  296  7e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  36.73 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  39.22 
 
 		 436 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  38.99 
 
 		 448 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  36.92 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  37.47 
 
 		 439 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  39.63 
 
 		 439 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  34.43 
 
 		 490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  36.49 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  36.47 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  36.78 
 
 		 439 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  36.26 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  35.31 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  23.88 
 
 		 631 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  25.56 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  27.73 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  28.42 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  28.7 
 
 		 697 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  23.39 
 
 		 578 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 		 387 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0034  secretion protein, HlyD family  35.35 
 
 		 369 aa  53.5  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  28.47 
 
 		 364 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  28.57 
 
 		 709 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  27.06 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4144  RND family efflux transporter MFP subunit  25.59 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.473768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  24.3 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  25.35 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  23.55 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 455 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  25.87 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  24.14 
 
 		 365 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  34.65 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  32.14 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  23.89 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  29.49 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  31.61 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.31 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  47.56 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  25.5 
 
 		 383 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  22.44 
 
 		 317 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 361 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 361 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50904  normal  0.396278 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 372 aa  47  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  35.71 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  35.56 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  24.51 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0673  multidrug resistance protein  27.15 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.26 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  26.5 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.23 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5654  secretion protein HlyD  28.35 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  35.71 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  42.86 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  34.44 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  31.45 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  37.14 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0618  putative phytochrome sensor protein  26.81 
 
 		 615 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  22.87 
 
 		 727 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  27.13 
 
 		 701 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1352  organic solvent efflux pump precursor (periplasmic linker protein component)  25.37 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.74 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  26.18 
 
 		 714 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  29.91 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  30.71 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.27 
 
 		 365 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.47 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.41 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  30.4 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  24.64 
 
 		 429 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  23.64 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  27.27 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.18 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  26.04 
 
 		 627 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 		 355 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  24.66 
 
 		 369 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  52.83 
 
 		 372 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  25.37 
 
 		 359 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  24.66 
 
 		 361 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 380 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  27.33 
 
 		 355 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  55.77 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2361  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  34.23 
 
 		 172 aa  43.9  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.439727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  27.33 
 
 		 355 aa  43.9  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  27.52 
 
 		 366 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 		 355 aa  43.9  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  27.33 
 
 		 355 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>