97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0478 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  875    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  84.51 
 
 		 439 aa  739    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  77.15 
 
 		 442 aa  668    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  78.51 
 
 		 442 aa  686    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  63.16 
 
 		 439 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  60.36 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  37.58 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  36.23 
 
 		 490 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  38.24 
 
 		 457 aa  266  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  36.14 
 
 		 446 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  35.19 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  38.97 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  37.36 
 
 		 449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  38.88 
 
 		 451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  37.91 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  37.24 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  31.38 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  32.58 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  29.69 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  26.82 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  25.37 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  24.38 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  26.7 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  23.46 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.48 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  28.26 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  28.26 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2177  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.795187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  27.33 
 
 		 611 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  25.83 
 
 		 741 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  25.15 
 
 		 727 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  28.24 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  29.44 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  22.82 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  28.47 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.96 
 
 		 340 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2759  hypothetical protein  24.4 
 
 		 681 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172121  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  28.79 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  27.65 
 
 		 619 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  28.86 
 
 		 715 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  24.88 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  27.62 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.82 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  25.42 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.69 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  23.3 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  32.23 
 
 		 376 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.76 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00325  cation efflux system protein  27.49 
 
 		 244 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  27.74 
 
 		 265 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  25.76 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2400  GAF domain-containing protein  24.49 
 
 		 628 aa  47  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2470  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  25.52 
 
 		 627 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  24.26 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  24.15 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  22.42 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  30.82 
 
 		 369 aa  46.6  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1992  secretion protein HlyD  26.38 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.85 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  23.5 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.4 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  24.26 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1352  organic solvent efflux pump precursor (periplasmic linker protein component)  25.56 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  35.25 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02838  hypothetical protein  24.03 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  24.24 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  31.47 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  21.96 
 
 		 701 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.19 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  24.67 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1510  secretion protein HlyD  26.46 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4325  secretion protein HlyD family protein  39.68 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0907  hypothetical protein  23.53 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003046  membrane-fusion protein  21.54 
 
 		 377 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  23.86 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  32.8 
 
 		 302 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  26.51 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5838  hypothetical protein  32.29 
 
 		 636 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  26.48 
 
 		 281 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  32 
 
 		 523 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3333  RND family efflux transporter MFP subunit  26.06 
 
 		 377 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  29.5 
 
 		 352 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.78 
 
 		 505 aa  43.5  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  26.32 
 
 		 307 aa  43.5  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  36.67 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 369 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.3 
 
 		 369 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 369 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>