39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5838 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5838  hypothetical protein  100 
 
 		 636 aa  1257    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 498 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  31.5 
 
 		 383 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  29.47 
 
 		 380 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7712  RND family efflux transporter MFP subunit  30.71 
 
 		 383 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.8 
 
 		 380 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  28.65 
 
 		 404 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 521 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  28.24 
 
 		 576 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  28.24 
 
 		 576 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  23.27 
 
 		 329 aa  48.5  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.58 
 
 		 365 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  32.28 
 
 		 614 aa  47.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 		 663 aa  47.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  28.49 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  30.83 
 
 		 365 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 		 903 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  29.73 
 
 		 364 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  32.06 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  25 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 360 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.76 
 
 		 480 aa  45.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  28.46 
 
 		 379 aa  44.3  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 350 aa  44.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  26.03 
 
 		 688 aa  44.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 362 aa  44.3  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  28.65 
 
 		 361 aa  44.3  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  23.74 
 
 		 377 aa  44.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  28.25 
 
 		 400 aa  44.3  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  31.69 
 
 		 702 aa  44.3  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  30.26 
 
 		 645 aa  44.3  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000227  periplasmic linker protein  29.44 
 
 		 353 aa  43.9  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.53 
 
 		 451 aa  44.3  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 		 392 aa  43.9  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  32.29 
 
 		 436 aa  43.9  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 360 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  23.35 
 
 		 864 aa  43.9  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>