260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4325 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4325  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 322 aa  607  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0128  secretion protein HlyD family protein  53.33 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1410  secretion protein HlyD family protein  45.71 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3340  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  28.33 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  28.98 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  26.54 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  29.48 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  26.54 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  32.04 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  26.01 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  31.09 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  28.1 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 		 416 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  28.01 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.17 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  27.94 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  23.45 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  25.42 
 
 		 412 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2645  hypothetical protein  24.42 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  28.35 
 
 		 384 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 406 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.3 
 
 		 438 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  28.02 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  29 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 406 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  29 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3333  RND family efflux transporter MFP subunit  30.86 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.81 
 
 		 438 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 		 405 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  26.48 
 
 		 407 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  28.43 
 
 		 281 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  30 
 
 		 380 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.43 
 
 		 410 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  30.86 
 
 		 384 aa  52.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2261  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0232169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  28.93 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 438 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.86 
 
 		 496 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.86 
 
 		 496 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  25.97 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 376 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  26.11 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3658  multidrug resistance efflux pump  27.89 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.4 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  30 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  31.21 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  28.76 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  29.56 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  34.58 
 
 		 442 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  30.77 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  24.79 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.07 
 
 		 422 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  34.58 
 
 		 442 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2231  multidrug resistance efflux pump-like  28.14 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 388 aa  50.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  28.16 
 
 		 436 aa  49.7  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  32.4 
 
 		 430 aa  49.7  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 		 407 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 		 405 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  28.04 
 
 		 439 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  24.02 
 
 		 429 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  27.5 
 
 		 368 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.48 
 
 		 433 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  33.62 
 
 		 392 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  24.79 
 
 		 378 aa  49.3  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  27.03 
 
 		 390 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2870  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 351 aa  49.3  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.551784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  29.1 
 
 		 340 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  28.76 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.09 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.14 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  28.39 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  27.75 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  23.7 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.61 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.61 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.61 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2470  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  26.61 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.06 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  29.54 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  29.54 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.85 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.15 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  29.54 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  28.33 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.13 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.06 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  30.28 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  28.73 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  28.81 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>