More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1410 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1410  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 304 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0128  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4325  secretion protein HlyD family protein  45.35 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3340  secretion protein HlyD family protein  30.3 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0420  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  25.64 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  25.13 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  28.43 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  29.55 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  25.13 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  28.79 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  29.5 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  29 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  24.46 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  32.64 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  27.6 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  24.82 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.77 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.72 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  26.56 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4391  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  24.62 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  25.96 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  26.8 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  27.32 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  25.27 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  24.62 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  27.57 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.72 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  28.25 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  26.56 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  26.14 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.72 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  24.62 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  24.62 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  24.89 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  27.16 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  25.89 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  24.62 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  24.62 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  24.62 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.06 
 
 		 453 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 		 409 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  24.62 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  24.62 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  24.62 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  26.09 
 
 		 390 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.19 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  28.63 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1570  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 375 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.628485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  28.43 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0718692  normal  0.0182823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6350  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.29 
 
 		 447 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  28.08 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  27.37 
 
 		 416 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  25 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  27.35 
 
 		 379 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  26.84 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  23.16 
 
 		 357 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 424 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.17 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.22 
 
 		 409 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.9 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  25.43 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  30.67 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2674  secretion protein HlyD family protein  27.03 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0130408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.9 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  23.74 
 
 		 377 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.38 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.82 
 
 		 414 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  27.93 
 
 		 405 aa  53.1  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 		 376 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  27.72 
 
 		 358 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.82 
 
 		 410 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 416 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  26.92 
 
 		 354 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 		 391 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.4 
 
 		 379 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  24.15 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  24.57 
 
 		 400 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 416 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.8 
 
 		 388 aa  52.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  27.54 
 
 		 263 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  27.2 
 
 		 332 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  24.79 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  27.38 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>