More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3340 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3340  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 334 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1410  secretion protein HlyD family protein  30.3 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0128  secretion protein HlyD family protein  32.84 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  29 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  25.51 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4325  secretion protein HlyD family protein  29.84 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.89 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.89 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  24.37 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.19 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  29.71 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  29.18 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  29.71 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  29.71 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  29.71 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  29.71 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  27.05 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  29.71 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  29.71 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  29.71 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  31.94 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  30.86 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.28 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.83 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  29.61 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  30.05 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  29.29 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  24.05 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.18 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  28.85 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.12 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  26.33 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  27.6 
 
 		 402 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  23.55 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  27.49 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  28.81 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  26.59 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  26.59 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  26.59 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  25.9 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  29.22 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.04 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  26.16 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  29.1 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  24.2 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  29.1 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  29.84 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  27.48 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  25.91 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  33.83 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  26.75 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  26.15 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  25.55 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  26.09 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  30.48 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  27.23 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  29.1 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  29.1 
 
 		 455 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  29.1 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  27.64 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  24.88 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  29.1 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 		 432 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  29.1 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.1 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.87 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 419 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  23.64 
 
 		 398 aa  62.4  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 442 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  26.09 
 
 		 397 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  24.36 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  23.37 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  23.51 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  25.11 
 
 		 400 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  24.66 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>