More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0128 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0128  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 314 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4325  secretion protein HlyD family protein  55.04 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1410  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 304 aa  195  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3340  secretion protein HlyD family protein  32.84 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  31.75 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  30.16 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.11 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  31.09 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  31.09 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  31.09 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  31.09 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  31.09 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  28.77 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.69 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  25.23 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.7 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  31.4 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  31.4 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  31.4 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  31.4 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  29.74 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.92 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  30.26 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.54 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  30.54 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.54 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  30.54 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  29.02 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  29.19 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  29.78 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  29.78 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  29.78 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  29.78 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  29.78 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.92 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  29.78 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  29.17 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  29.88 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  28.88 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  29.78 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  28.52 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.14 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  28.4 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  28.46 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  28 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  30.93 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2200  secretion protein HlyD family protein  29.68 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.353788  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  26.76 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  29.86 
 
 		 384 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  25.53 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  23.78 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2021  secretion protein HlyD family protein  27.19 
 
 		 413 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  27.24 
 
 		 418 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  24.59 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.79 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.69 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.79 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  25.53 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  29.74 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  29.63 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  28.69 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  28.11 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  28.74 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  25.53 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.62 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.56 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.26 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0420  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28.89 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  30.26 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  27.23 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  29.79 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  25.64 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  28.78 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0859  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556695  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.69 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  26.29 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  30.32 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  30.32 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  26.29 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  28.33 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  30.32 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  30.32 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  26.5 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  30.32 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28.89 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  30.32 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25.43 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  26.02 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28.89 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  28.45 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>