More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2261 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2261  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 408 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0232169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  71.72 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  33.21 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.94 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.34 
 
 		 476 aa  99.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  31.1 
 
 		 425 aa  96.3  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  29.63 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  30.04 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  32.17 
 
 		 342 aa  95.5  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  32.89 
 
 		 443 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  31.62 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  32.05 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.97 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  30.65 
 
 		 402 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 417 aa  90.1  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  30.23 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  30.16 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  32.41 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  30.43 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  28.17 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  24.32 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  31.1 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  30.07 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  29.2 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  29.2 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.6 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.73 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  28.46 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  26.59 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  28.66 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  28.29 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  24.92 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.17 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.35 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.84 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  25.48 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  25.48 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  25.48 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  29.25 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  23.53 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  27.21 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.21 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  31.3 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.95 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.93 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  26.72 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  26.72 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  25.37 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  29.44 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  25.83 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  24.8 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  26.14 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 1462 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.87 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.87 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  23.53 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  26.59 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  24.07 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  24.07 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  24.07 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  23.98 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  24.07 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  24.07 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  24.07 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  24.07 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.47 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  24.07 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  26.25 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.96 
 
 		 365 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  28.78 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.79 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2224  multidrug efflux pump, membrane fusion protein  31.13 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  28.96 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  23.98 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  30.51 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  26.34 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  25.09 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>