84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0669 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  850    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  70.84 
 
 		 439 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  61.05 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  60.91 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  58.6 
 
 		 442 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  60.42 
 
 		 442 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  42.04 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  39.55 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  38.21 
 
 		 490 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  37.75 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  40.24 
 
 		 451 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  34.98 
 
 		 446 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  35.31 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  41.24 
 
 		 448 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  40.05 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  38.84 
 
 		 442 aa  246  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  37.04 
 
 		 449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  36.12 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  27.92 
 
 		 614 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  28.46 
 
 		 631 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  30.92 
 
 		 289 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  31.49 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  30.92 
 
 		 289 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  26.44 
 
 		 611 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  30.53 
 
 		 288 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  28.68 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00325  cation efflux system protein  30 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.39 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.58 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  27.27 
 
 		 359 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  25.77 
 
 		 578 aa  50.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  35.63 
 
 		 661 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2177  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.14 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.795187  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  23.04 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  29.48 
 
 		 619 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  33.81 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2759  hypothetical protein  23.91 
 
 		 681 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172121  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  25.94 
 
 		 394 aa  48.5  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 313 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  25.5 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.73 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  24.16 
 
 		 376 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0370  hypothetical protein  26.89 
 
 		 274 aa  47  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.131053  normal  0.52823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 379 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  27.01 
 
 		 367 aa  47  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.96 
 
 		 549 aa  47  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  24.12 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  43.86 
 
 		 589 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  24.83 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  23.4 
 
 		 402 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  26.79 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.76 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0907  hypothetical protein  23.53 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.4 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  34.78 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  25.94 
 
 		 727 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39 
 
 		 350 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  26.42 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.87 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  32.92 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 372 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.94 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.75 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01876  hypothetical protein  25 
 
 		 359 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  27.23 
 
 		 302 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.59 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003810  linker protein putative  26.12 
 
 		 365 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.63 
 
 		 362 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  29.44 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  28.98 
 
 		 367 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  24.67 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  32.86 
 
 		 317 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  26.83 
 
 		 350 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  30.41 
 
 		 294 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.89 
 
 		 383 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  45 
 
 		 1238 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35 
 
 		 357 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 		 358 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  24.29 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>