28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1154 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  998    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  37.17 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  36.23 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  37.99 
 
 		 439 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  34.33 
 
 		 457 aa  262  8e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  35 
 
 		 442 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  35.27 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  35.87 
 
 		 439 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  35.33 
 
 		 436 aa  256  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  32.9 
 
 		 446 aa  253  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  35.68 
 
 		 451 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  32.48 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  35.68 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  34.99 
 
 		 449 aa  226  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  32.4 
 
 		 448 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  35.18 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  31.15 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  30.57 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  26.1 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  24.84 
 
 		 611 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1992  secretion protein HlyD  27.04 
 
 		 374 aa  50.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  23.78 
 
 		 741 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  23.61 
 
 		 614 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.82 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  25.13 
 
 		 578 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  29.37 
 
 		 378 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.68 
 
 		 453 aa  43.9  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0942  putative secretion protein, HlyD family  30.3 
 
 		 407 aa  43.5  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>