32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2586 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2586  peptidase M50  100 
 
 
398 aa  773    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0867548  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2431  peptidase M50  84.15 
 
 
410 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0730109  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  31.99 
 
 
756 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  32.25 
 
 
741 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  26.7 
 
 
715 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  26.46 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  27.11 
 
 
715 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  23.35 
 
 
741 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  26.17 
 
 
1171 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  26.94 
 
 
736 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1862  hypothetical protein  26.92 
 
 
865 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1836  hypothetical protein  26.92 
 
 
865 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  30.26 
 
 
699 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  22.89 
 
 
721 aa  50.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  25.3 
 
 
474 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  26.43 
 
 
1177 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  31.84 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  19.81 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  30.65 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  26.79 
 
 
224 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  26.79 
 
 
224 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  26.79 
 
 
224 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  25.6 
 
 
224 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  26.79 
 
 
224 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  25.6 
 
 
224 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  26.79 
 
 
224 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  25.73 
 
 
224 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  25.73 
 
 
224 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  25 
 
 
224 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  26.19 
 
 
224 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  31.17 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  27.06 
 
 
720 aa  42.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0961426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>