30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2431 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2431  peptidase M50  100 
 
 		 410 aa  792    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0730109  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2586  peptidase M50  82.93 
 
 		 398 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0867548  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  33.33 
 
 		 756 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  32.04 
 
 		 741 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  24.61 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  22.48 
 
 		 741 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  24.39 
 
 		 715 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  25.89 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  24.61 
 
 		 1171 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  30.65 
 
 		 736 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1862  hypothetical protein  24.71 
 
 		 865 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1836  hypothetical protein  24.71 
 
 		 865 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  29.17 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  29.17 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  29.17 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  29.17 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  27.98 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  27.98 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  26.36 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  29.17 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  29.44 
 
 		 699 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  27.38 
 
 		 224 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  32.96 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  28.57 
 
 		 224 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  27.49 
 
 		 224 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  27.49 
 
 		 224 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  23.14 
 
 		 715 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  22.77 
 
 		 720 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  22.05 
 
 		 721 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  26.6 
 
 		 720 aa  43.5  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>