154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1793 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 1124 aa  803    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  78.87 
 
 		 1177 aa  1804    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 1171 aa  2321    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2627  cyclic nucleotide-binding protein  78.15 
 
 		 168 aa  224  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  27.9 
 
 		 948 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  26.65 
 
 		 367 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  43.17 
 
 		 238 aa  99.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  35.76 
 
 		 736 aa  94.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  29.17 
 
 		 709 aa  91.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  25.64 
 
 		 741 aa  90.1  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  29.63 
 
 		 711 aa  89.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  30.36 
 
 		 698 aa  88.6  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  35.81 
 
 		 707 aa  88.2  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  33.13 
 
 		 701 aa  88.2  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  33.77 
 
 		 701 aa  85.5  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  34.5 
 
 		 720 aa  84.7  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  30.96 
 
 		 715 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  35.95 
 
 		 699 aa  83.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  32.57 
 
 		 720 aa  83.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  27.33 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  33.11 
 
 		 702 aa  81.6  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  30.49 
 
 		 709 aa  81.6  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  30.96 
 
 		 720 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  29.95 
 
 		 714 aa  80.1  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  34.06 
 
 		 719 aa  79.7  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  30.23 
 
 		 715 aa  79.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  34.16 
 
 		 701 aa  77.4  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  30.43 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  26.34 
 
 		 241 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  32.02 
 
 		 697 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  24.01 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  25.72 
 
 		 703 aa  73.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  28.1 
 
 		 715 aa  72.8  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  32.7 
 
 		 709 aa  72.4  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  26.69 
 
 		 474 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  36.22 
 
 		 714 aa  70.1  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  34.75 
 
 		 688 aa  69.7  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  33.33 
 
 		 696 aa  70.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  28.02 
 
 		 482 aa  67.8  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.5 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  24.22 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  26.28 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.86 
 
 		 1018 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  24.33 
 
 		 1040 aa  62.4  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  30.66 
 
 		 721 aa  61.6  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 506 aa  61.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 		 308 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 		 419 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.46 
 
 		 220 aa  59.7  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  26.47 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  22.36 
 
 		 263 aa  57.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 		 238 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.81 
 
 		 1056 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  24.83 
 
 		 1018 aa  56.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  28.49 
 
 		 1043 aa  56.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  32.35 
 
 		 603 aa  55.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 222 aa  55.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  30.28 
 
 		 628 aa  54.7  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 501 aa  54.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  27.74 
 
 		 176 aa  54.3  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.93 
 
 		 224 aa  54.3  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  25.95 
 
 		 838 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  28.57 
 
 		 121 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 505 aa  53.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  27.07 
 
 		 419 aa  53.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  28.99 
 
 		 570 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11017  hypothetical protein  33.08 
 
 		 333 aa  52.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.210732  normal  0.341372 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.83 
 
 		 1018 aa  52.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.2 
 
 		 225 aa  52  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  36.89 
 
 		 225 aa  52  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 		 489 aa  52  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 		 225 aa  52  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27248  predicted protein  25.26 
 
 		 680 aa  51.6  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.2735 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29662  predicted protein  25.26 
 
 		 680 aa  51.6  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226582  normal  0.0425728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  26.11 
 
 		 482 aa  51.6  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  28.67 
 
 		 350 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  27.87 
 
 		 417 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 		 412 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 238 aa  50.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  28.93 
 
 		 226 aa  50.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  26.76 
 
 		 824 aa  50.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.75 
 
 		 225 aa  50.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 141 aa  50.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 231 aa  49.7  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2431  peptidase M50  24.32 
 
 		 410 aa  49.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0730109  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  26.06 
 
 		 629 aa  49.3  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  26.06 
 
 		 626 aa  49.3  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 246 aa  49.3  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  31.93 
 
 		 397 aa  49.3  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 637 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  25.42 
 
 		 847 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  25.42 
 
 		 847 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  29.71 
 
 		 222 aa  48.9  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  25.42 
 
 		 844 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 		 623 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11692  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 244 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.476097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.08 
 
 		 225 aa  48.9  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 227 aa  48.5  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 224 aa  48.9  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  23.47 
 
 		 238 aa  48.9  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>