More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11692 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11692  transcriptional regulator  100 
 
 
244 aa  485  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.476097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2084  cyclic nucleotide-binding  46.05 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
226 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.11 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.65 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.19 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.15 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.88 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  27.27 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.05 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.54 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1859  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.79 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.35 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  27.7 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  28.65 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.7 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.22 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.09 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.34 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.88 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  27.75 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.38 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  26.2 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.87 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  26.53 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
226 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.57 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.34 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.64 
 
 
243 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  26.2 
 
 
224 aa  62  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.64 
 
 
243 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.54 
 
 
226 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  24.6 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 
253 aa  62  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 
171 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.33 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.81 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.6 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  25.97 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.85 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.89 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2066  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.9 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  29.6 
 
 
563 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.65 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.81 
 
 
251 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 
224 aa  58.9  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.4 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.87 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  27.17 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.87 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  27.14 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.06 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  22.12 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  19.68 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.34 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  23.79 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  25.95 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  35.64 
 
 
641 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.5 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0644  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.28 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000386152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.49 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0259  cyclic nucleotide-binding protein  26.46 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.44 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.07 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.6 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.48 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.12 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.63 
 
 
223 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 
492 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  31.03 
 
 
231 aa  55.5  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>