More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A06 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  475  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.05 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  38.77 
 
 
221 aa  167  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  34.84 
 
 
235 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
236 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
239 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
236 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
232 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1425  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
212 aa  122  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2066  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1045  Crp-like transcriptional regulator  31.67 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1838  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.3 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0983527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.35 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0984  Crp-like transcriptional regulator  34.83 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
222 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
236 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  27.91 
 
 
223 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
249 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
236 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  32.41 
 
 
231 aa  105  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  28.04 
 
 
222 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
226 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
225 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.82 
 
 
225 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.17 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.33 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.47 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.47 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.69 
 
 
236 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1007  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
164 aa  95.1  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.13 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  28.79 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0796  cyclic nucleotide-binding protein  28.18 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  30.09 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.02 
 
 
224 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.19 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  23.74 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.11 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  24.66 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  25.63 
 
 
225 aa  92  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
231 aa  91.7  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
253 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
231 aa  91.7  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1123  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.36 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.7 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.27 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 
225 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  24.09 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  27.27 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  23.74 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
231 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.76 
 
 
236 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 
229 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.49 
 
 
231 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
241 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.86 
 
 
239 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  28.65 
 
 
352 aa  88.6  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0270  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.78 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.479827  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0447  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.78 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1887  FNR/CRP family transcriptional regulator  27.8 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000504679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.53 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.1 
 
 
254 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
229 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.81 
 
 
250 aa  86.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.15 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.48 
 
 
237 aa  85.9  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.76 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.18 
 
 
228 aa  85.5  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
249 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>