More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA05510 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  100 
 
 
482 aa  989    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  46.69 
 
 
412 aa  293  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  35 
 
 
441 aa  231  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  33.2 
 
 
241 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  30.74 
 
 
263 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12655  predicted protein  35.44 
 
 
260 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10848  predicted protein  30.91 
 
 
261 aa  127  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  32.42 
 
 
238 aa  113  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  31.39 
 
 
528 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27248  predicted protein  27.84 
 
 
680 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.2735 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29662  predicted protein  27.84 
 
 
680 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226582  normal  0.0425728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  30.86 
 
 
482 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  30.29 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  37.5 
 
 
121 aa  77.4  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  32.1 
 
 
477 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.79 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  24.8 
 
 
801 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  28.02 
 
 
1171 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.45 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.38 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.43 
 
 
223 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  31.79 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 
224 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  32.17 
 
 
449 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
222 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  21.61 
 
 
811 aa  63.9  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.67 
 
 
220 aa  63.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  28.5 
 
 
454 aa  63.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3722  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.47 
 
 
760 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44099  normal  0.232019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
241 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
229 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  33.87 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 
219 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  24 
 
 
233 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  35.23 
 
 
214 aa  60.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
169 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
225 aa  60.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
225 aa  60.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
238 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.23 
 
 
225 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  33.63 
 
 
409 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  28.57 
 
 
222 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
246 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  25.91 
 
 
1177 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  27.84 
 
 
161 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.25 
 
 
146 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 
512 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  38.1 
 
 
367 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 
286 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.46 
 
 
236 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
425 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  27.48 
 
 
570 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
425 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
226 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.26 
 
 
238 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 
412 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  26.81 
 
 
154 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  28.89 
 
 
155 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
225 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.35 
 
 
858 aa  56.6  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
239 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.15 
 
 
155 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
129 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
225 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.17 
 
 
238 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  30.39 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
232 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.97 
 
 
226 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
247 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
233 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 
495 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  30.97 
 
 
413 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
233 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
233 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
236 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  32.48 
 
 
369 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4818  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 
332 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931859  normal  0.928656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 
594 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
171 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  34.95 
 
 
164 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
222 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
236 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.55 
 
 
225 aa  54.3  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.11 
 
 
242 aa  54.3  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  27.27 
 
 
322 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 
563 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
236 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
236 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.93 
 
 
243 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.77 
 
 
225 aa  53.5  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  31.25 
 
 
153 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
226 aa  53.5  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  30.36 
 
 
153 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.37 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  30.61 
 
 
1018 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.93 
 
 
232 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  26.73 
 
 
212 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>