84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2627 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2627  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 168 aa  327  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  95.45 
 
 		 1177 aa  284  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  78.15 
 
 		 1171 aa  210  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  44.97 
 
 		 1124 aa  117  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.79 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 		 308 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.06 
 
 		 419 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  34.17 
 
 		 410 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 506 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.1 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  26.89 
 
 		 241 aa  52.4  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  30.36 
 
 		 121 aa  52.4  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.19 
 
 		 238 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.2 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.2 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  29.06 
 
 		 528 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.52 
 
 		 409 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  28.47 
 
 		 417 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  27.27 
 
 		 419 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.08 
 
 		 487 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4914  cyclic nucleotide-binding protein  27.7 
 
 		 943 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 489 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  27.82 
 
 		 603 aa  47.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  29.71 
 
 		 570 aa  47.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.69 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1753  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 357 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  32.11 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  34.21 
 
 		 367 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  28.37 
 
 		 628 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  31.9 
 
 		 482 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.36 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  21.48 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 234 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1482  hypothetical protein  26.21 
 
 		 401 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 505 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  33.33 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 		 1056 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1501  hypothetical protein  26.21 
 
 		 401 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 501 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  28.67 
 
 		 923 aa  44.3  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  23.48 
 
 		 227 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3296  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.06 
 
 		 229 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.721133  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2804  cyclic nucleotide-binding protein  24.06 
 
 		 229 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0952  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.422759  hitchhiker  0.0019689 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  28.37 
 
 		 449 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 1043 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  29.36 
 
 		 350 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 408 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0845  diguanylate cyclase  24.06 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0067  cyclic nucleotide-binding protein  38.03 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.821564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  29.13 
 
 		 482 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  25.76 
 
 		 868 aa  42.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  31.03 
 
 		 482 aa  42.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.38 
 
 		 238 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 		 412 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.25 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 231 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 637 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  28.45 
 
 		 238 aa  42  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 231 aa  42  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 254 aa  42  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  23.4 
 
 		 225 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5384  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.81 
 
 		 257 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0141215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 		 212 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 239 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 225 aa  41.2  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29 
 
 		 424 aa  41.2  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.95 
 
 		 227 aa  40.8  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 235 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  25.87 
 
 		 225 aa  40.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 485 aa  40.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>