276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1612 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
154 aa  300  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  99.35 
 
 
154 aa  298  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  97.4 
 
 
154 aa  292  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  77.7 
 
 
153 aa  234  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  30.2 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  34.92 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.03 
 
 
231 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.15 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 
237 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.57 
 
 
243 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
228 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.33 
 
 
228 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.69 
 
 
242 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.23 
 
 
226 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.71 
 
 
225 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 
220 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  29.05 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.35 
 
 
225 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
230 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.06 
 
 
228 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  29.73 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  33.94 
 
 
308 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
230 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
225 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.77 
 
 
225 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
227 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.17 
 
 
224 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.58 
 
 
225 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  31.43 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.09 
 
 
1075 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
228 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  31.91 
 
 
219 aa  55.1  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.77 
 
 
1056 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
211 aa  54.7  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.24 
 
 
227 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.88 
 
 
227 aa  54.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
226 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 
227 aa  54.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  32.46 
 
 
220 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 
410 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
248 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  29.41 
 
 
226 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
237 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  24.46 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.08 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.14 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2391  cyclic nucleotide-binding protein  26.43 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
157 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.14 
 
 
225 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  26.35 
 
 
154 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  24.64 
 
 
154 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  28.57 
 
 
224 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.65 
 
 
226 aa  51.2  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
239 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
228 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.19 
 
 
230 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.89 
 
 
251 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  31.86 
 
 
281 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.77 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  24.65 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  30 
 
 
212 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  26.76 
 
 
747 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
230 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.01 
 
 
225 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.41 
 
 
238 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  30.51 
 
 
322 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
232 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3582  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.67 
 
 
554 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0031716  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.07 
 
 
232 aa  50.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.89 
 
 
235 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  29.81 
 
 
171 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.83 
 
 
219 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.49 
 
 
225 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 
235 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 
235 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.53 
 
 
226 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
231 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.7 
 
 
222 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
241 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  27.94 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  27.21 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  30.65 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
233 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
234 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2490  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.529165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2535  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187626  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
233 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2527  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.86 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1689  cyclic nucleotide-binding protein  28.95 
 
 
212 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  27.93 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>