51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3220 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  100 
 
 
413 aa  845    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  98.72 
 
 
235 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3230  sterol-regulatory element binding protein  98.83 
 
 
171 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  25.6 
 
 
824 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  24.05 
 
 
838 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  22.54 
 
 
825 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  23.1 
 
 
847 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  23.1 
 
 
844 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  23.1 
 
 
847 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  38.24 
 
 
736 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  33.55 
 
 
703 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  22.97 
 
 
497 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  26.69 
 
 
709 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  30.17 
 
 
719 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  24.83 
 
 
812 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  34.64 
 
 
688 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  22.7 
 
 
761 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  24.48 
 
 
1124 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  25.57 
 
 
1177 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  36.43 
 
 
714 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  25.86 
 
 
474 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  28.99 
 
 
699 aa  80.5  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  34.07 
 
 
701 aa  79.7  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  31.29 
 
 
697 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  27.14 
 
 
709 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  24.26 
 
 
698 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  24.31 
 
 
696 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  22.36 
 
 
1171 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  27.48 
 
 
720 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  24.89 
 
 
702 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  26.19 
 
 
709 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  28.19 
 
 
701 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  29.93 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  28.57 
 
 
707 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  28.47 
 
 
720 aa  67  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  28.38 
 
 
701 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  22.79 
 
 
715 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  25.65 
 
 
367 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  24.11 
 
 
715 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  28.15 
 
 
715 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  26.47 
 
 
741 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  24.8 
 
 
948 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  29.29 
 
 
720 aa  56.2  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  25.13 
 
 
350 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  24.85 
 
 
721 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  26.09 
 
 
714 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  25.68 
 
 
715 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  25 
 
 
711 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  22.92 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  32.48 
 
 
360 aa  42.7  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>