43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1596 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  955    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  39.67 
 
 		 825 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  37.41 
 
 		 838 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  37.53 
 
 		 847 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  37.53 
 
 		 847 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  37.53 
 
 		 844 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  40.04 
 
 		 761 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  36.61 
 
 		 824 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  40.21 
 
 		 812 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  22.97 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  32.84 
 
 		 720 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  24.19 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  34.53 
 
 		 719 aa  74.3  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  31.9 
 
 		 696 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  35.95 
 
 		 697 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  35.71 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  30 
 
 		 699 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  32.69 
 
 		 702 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  28.11 
 
 		 720 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  33.33 
 
 		 701 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  32.26 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  31.61 
 
 		 707 aa  60.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  34.81 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  31.47 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  33.15 
 
 		 701 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  28.21 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  34.53 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  30.94 
 
 		 714 aa  57.4  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  29.79 
 
 		 709 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  25.99 
 
 		 703 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  28.11 
 
 		 1124 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  26.92 
 
 		 715 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  29.41 
 
 		 715 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  30.66 
 
 		 701 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  30.88 
 
 		 736 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  28.47 
 
 		 709 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  27.97 
 
 		 741 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  26.83 
 
 		 1171 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  25.64 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  32.03 
 
 		 948 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  26.46 
 
 		 1177 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  24.88 
 
 		 715 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>